ロックマン ゼクス
ボス名称 | 弱点属性 | 入手モデル |
| ギガアスピス | 無し | |
| ウォーライア | 無し | |
| ジルウェ（モデルＺ） | 無し | モデルＺＸ |
ボス名称 | 弱点属性 | ミッション名 | 入手モデル | 入手技 |
| ハイボルト・ザ・ラプタロイド | 氷 | 発電所の調査 | モデルＨＸ | - |
| ルアール・ジ・アビスロイド | 炎 | 遭難者の探索 | モデルＬＸ | - |
| フィストレオ・ザ・プレデトロイド | 雷 | イレギュラーの撃退 | モデルＦＸ | - |
| パープリル・ザ・マンドロイド | 無し | ライブメタルの追跡 | モデルＰＸ | - |
| ハリケンヌ・ザ・ウルバロイド | 氷 | 民間人の救出 | - | プラズマサイクロン |
| レグアンカー・ザ・ゲルロイド | 炎 | データディスクの奪還 | - | 氷龍 |
| フランマール・ザ・モルロイド | 雷 | 発掘部隊の襲撃 | - | グラウンドブレイク |
| プロテクタス・ザ・ゴアロイド | 無し | 研究所の防衛 | - | バリア |
強制ミッション ベースの防衛
ボス名称 | 弱点属性 |
| プロメテ（通常） （赤） | 無し 雷 |
ボス名称 | 弱点属性 |
| パンドラ（通常） （黄） | 炎 氷 |
| プロメテ（通常） （赤） パンドラ（通常） （黄） |
無し 雷 炎 氷 |
| セルパン（モデルＶ） | 無し |
| セルパン（最終形態） | 無し |
エリアＮ
ボス名称 | 弱点属性 |
| ブレイジン・フリザード | 雷 |
| チルドレ・イナラビッタ | 炎 |
| ヘルバット・シルト | 氷 |
| デスタンツ・マンティスク | 無し |
| ソル・ティターニャン | 雷 |
| フェンリー・ルナエッジ | 炎 |
| ペガソルタ・エクレール | 氷 |
| ノービル・マンドラゴ | 無し |
| オメガ | 無し |
ロックマン ゼクス アドベント
ボス名称 | 弱点属性 |
| クレイド・ザ・ジャイアント | 無し |
ボス名称 | 弱点属性 | 属性 |
| ディアバーン・ザ・ガゼロイド | 雷 | 炎 |
| ローズパーク・ザ・フラワロイド | 氷 | 雷 |
| クロノフォス・ザ・トリデンロイド | 炎 | 氷 |
| アトラス（モデルＦ） | 雷 | 氷 |
| シャナクル（モデルＰ） | 無し | 無 |
ボス名称 | 弱点属性 | 属性 | 備考 |
| カイゼミーネ・ザ・ワスプロイド | 雷 | 炎 | |
| テティス（モデルＬ） | 炎 | 氷 | |
| ヘリオス（モデルＨ） | 氷 | 雷 | |
| コンドロック・ザ・バルチャロイド | 無し | 無 | |
| ヴァン（モデルＺＸ） | 無し | 無 | アッシュ使用時に登場 |
| エール（モデルＺＸ） | 無し | 無 | グレイ使用時に登場 |
ボス名称 | 弱点属性 | 属性 |
| アーゴイル・ザ・シーサロイド ウーゴイル・ザ・シーサロイド | 無し | 無 |
| テスラット・ザ・ヘッジロイド | 氷 | 雷 |
| バイフロスト・ザ・クロコロイド | 炎 | 氷 |
ボス名称 | 弱点属性 |
| プロメテ（通常） （赤） パンドラ（通常） （黄） |
無し 雷 炎 氷 |
| アルバート（第一形態） | 無し |
| アルバート（最終形態） | 無し |
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